手机健康码的升级生效时间主要取决于具体的升级类型和当地的疫情防控政策。以下是几种常见情况的生效时间：
黄码转绿码
一般需要24个小时。用户在提交申诉要求后，如果符合申诉改码条件，系统一般会在24小时以内处理完毕。如果在三天后仍不是绿码，可以联系社区工作人员进行转码。
健康码更新
在绿码的情况下，一般需要三天更新一次。在有效期内至少完成一次健康码登录才能延期，否则会转为黄码。不过，各个地区对于健康码的规定可能有所不同，有的地区可能没有时间限制，不用更新。
红码转绿码
如果是因为集中隔离或居家隔离14天，且这14天每天都坚持健康打卡无异常状态，则红码会自动转阴，变回绿色。如果是因为密接而被赋予红码，则14天只能转变为黄码，还需要再等7天才能够变回绿码。
申请转码
健康码申请转码一般需要1~3天左右。黄码人员携带身份证和七日内3次核酸阴性证明到转码办理点申请，审核通过后，工作人员将信息提交到健康码管理系统，疾控中心收到申请审核通过后，1小时之内即可完成转码。
综上所述，手机健康码的升级生效时间主要取决于具体的升级类型和当地的疫情防控政策。一般来说，黄码转绿码需要24小时，健康码更新通常需要三天，红码转绿码需要14天或更长时间，而申请转码则需要1~3天。建议根据当地的具体规定和流程进行操作，以确保健康码的顺利升级和生效。