公益诉讼的适用程序主要取决于案件类型以及相关法院的具体规定。以下是不同类型公益诉讼的适用程序：
民事公益诉讼
普通程序：通常适用民事诉讼法中的普通程序，包括立案、发送传票、开庭、判决等环节。
特殊规定：对于环境方面的公益诉讼，可以根据《最高人民法院关于审理环境民事公益诉讼案件适用法律若干问题的解释》进行特殊处理，由特定机构设立的环境资源审判庭专门审理，并可能有一些特殊的操作规程。
人民陪审制：人民检察院提起的第一审民事公益诉讼案件，原则上适用人民陪审制。当事人可以申请不适用人民陪审制，但需经法院审查决定。
和解与调解：人民检察院与被告达成和解协议或调解协议后，法院需将协议内容公告。若未达成和解，案件将在法庭进行辩论和判决。
行政公益诉讼
起诉与受理：检察机关在履行职责中发现行政机关违法行使职权或不作为，造成国家和社会公共利益受到侵害时，可以向人民法院提起行政公益诉讼。试点期间，重点是对生态环境和资源保护领域的案件提起行政公益诉讼。
诉前公告：在提起行政公益诉讼前，检察机关应向行政机关提出检察建议，督促其依法履行职责。行政机关应在两个月内依法履行职责，并书面回复。检察机关以公告方式告知法律规定的机关和有关组织提起诉讼，若已履行诉前公告程序，法院立案后不再进行公告。
审理程序：人民法院审理行政公益诉讼案件时，将依照法定程序进行。具体程序可能包括庭审准备、法庭调查、法律辩论、案件评议和宣告判决等环节。
刑事附带民事公益诉讼
审理程序：刑事附带民事公益诉讼的审理程序按照刑事诉讼法进行，包括庭审准备、法庭调查、法律辩论、案件评议和宣告判决等环节。
综上所述，公益诉讼的适用程序根据案件类型不同而有所区别，民事公益诉讼主要适用民事诉讼法和普通程序，行政公益诉讼则涉及特殊的诉前公告和审理程序，而刑事附带民事公益诉讼则遵循刑事诉讼法。