商标确权程序是指通过一系列专门的步骤来确定商标的归属权。当出现商标纠纷时，需要通过以下四个部门来进行确权：商标局、商评委以及一二审法院。整个确权流程可以分为以下几个阶段：
商标查询
申请人进行商标查询，以确定是否有相同或近似的商标已经注册或申请注册。
交付材料
申请人向商标局或其他相关部门提交相关的商标注册申请材料和证明文件。
材料审核
商标局或相关委员会对提交的材料进行审核，确认申请是否符合商标注册的基本要求。
实质审查
对商标进行实质审查，包括商标的合法性、显著性、是否侵犯他人权益等。
公告
如果没有异议，商标局会发布初步审定公告，公示一段时间以接受公众监督。
发放证书
公示期满无异议或异议解决后，商标局会发放商标注册证书，确认商标的权属。
行政诉讼
如果申请人或其他相关方对商标局的决定不服，可以向人民法院提起行政诉讼，请求重新审查或撤销原决定。
在整个商标确权过程中，申请人应当充分了解并遵守相关法律规定，确保申请材料的准确性和完整性，以便顺利通过审核和公示。同时，申请人也应注意维护自身的程序性权利，如申请复审等，以保障自身权益不受侵犯。