单机软件保护版权的方法主要包括以下几种：
登记保护
根据《计算机软件保护条例》和《中华人民共和国著作权法》，开发者独立开发的、已固定在某种有形物体上的计算机软件依法享有相应的版权。通过在中国版权保护中心或其他相关机构进行登记，可以获得法律保护，并在发生纠纷时作为有力的法律证据。
保密措施
在开发过程中，采取必要的保密措施，限制对源代码和其他关键信息的访问，以防止未经授权的复制和使用。
使用许可协议
通过使用许可协议，明确规定软件的使用范围、限制和授权条件，确保用户在合法范围内使用软件，同时限制未经授权的复制和分发。
版权声明
在软件中包含版权声明，明确标注软件的版权归属和保护信息，提醒他人注意版权问题，以减少侵权的可能性。
加密和数字签名
对软件进行加密处理，以防止未经授权的修改和复制。同时，使用数字签名技术，确保软件的完整性和真实性。
监测和维权
定期进行软件侵权监测，及时发现和处理侵权行为。如果发现侵权行为，可以采取法律手段维护自己的权益，包括发出警告函、提起诉讼等。
团队管理和保密协议
对于软件开发团队，建立严格的管理制度和保密协议，明确员工的责任和义务，保护软件的知识产权。
合理授权
如果希望其他人使用自己的软件，可以通过授权许可协议进行合理授权，明确规定使用条件和权益，确保合法使用和收益分享。
通过以上方法，单机软件开发者可以有效地保护自己的版权，防止他人未经授权地复制、分发或使用自己的软件。