软件企业做成本的方法可以分为以下几个步骤：
直接成本识别
直接成本是那些可以直接归属于特定软件开发项目的费用，包括但不限于人工成本（开发人员、测试人员、项目经理等的工资和奖金）、材料成本（软件开发工具、服务器租赁费用、云服务费用等）和外包成本（外部服务提供商的费用，如第三方测试服务）。
间接成本识别
间接成本是那些无法直接归属于特定项目，但与项目开发有密切关系的费用，包括但不限于办公费用（办公场所租金、水电费、办公设备折旧）、管理费用（行政人员薪资、管理层费用）和支持服务费用（IT支持、客户服务等）。
成本分配方法选择
选择合适的成本分配方法至关重要，这有助于确保成本分摊的公平性和准确性。常见的成本分配方法包括活动基础成本分配法（Activity-Based Costing, ABC），适用于较为复杂的项目；而简单的按工时分摊法则可能更适合小型项目。
成本核算
软件开发公司可以根据产品范围、功能点、用时、人数等参数，精确到最小的成本单元进行核算。这包括分析与设计费用、编码与测试费用、系统开发费用、网络部署费用等。
建立标准成本
公司需要建立标准成本，形成软件开发的成本核算标准。标准成本可以分为发行费用、质量保证费用、研发费用、技术支持费用等，并监控软件开发成本的走势，以保证公司软件开发成本的可控性及财务利益的最大化。
成本控制
在预算及招投标阶段，软件成本度量有助于制定合理的项目预算，规范招投标行为。常用的成本度量方法包括功能点计数和任务估算法。
成本核算流程优化
企业成本核算流程一般分为预算制定、成本核算和成本分析等环节。使用基于云计算的成本控制软件可以实时集成企业各部门的数据，进行快速灵活的成本核算，并优化整体成本核算流程。
通过以上步骤，软件企业可以更精确地核算和控制成本，从而提高企业的财务管理和市场竞争力。