在Unity中发布软件时，可以采用以下几种方法进行加密：
应用程序密码保护
打开Unity程序，在项目属性中找到“保护”选项卡。
设置应用程序密码，该密码用于打开应用程序时保护，必须输入正确的密码才能打开。
可以设置段密码，分为只读（可以打开不能修改）和不可读写（不让改，也不许看），并勾选“保护激活”选项使密码生效。
程序段密码保护等级可以在段的属性中选择。
序列号方式
使用第三方服务（如Bmob）生成序列号，并在Unity中通过脚本将序列号存储在数据库中。
在软件运行时，检查序列号是否有效，从而验证软件的合法性。
硬件加密锁
使用硬件加密锁设备（如域天D8加密锁）对EXE程序进行加密。
通过外壳加密工具包对EXE程序进行加壳，并可以设置限制时间和次数等。
加密后的程序需要插入加密锁设备才能运行。
DLL加密
对Unity生成的`Assembly-CSharp.dll`文件进行加密，避免或减缓源码被破解。
可以对mono源码中的解密算法进行加密，加强破解难度。
资源包加密
对Assetsbundle资源包进行加密，确保资源包内容无法被直接识别和使用。
可以采用对称加密算法对资源包进行加密，并在运行时解密。
使用专业的加密工具
使用专业的加密工具（如Virbox LM）对Unity项目进行加密，可以一键加密代码逻辑，达到无法反编译源码的安全级别。
建议
选择合适的加密方法：根据项目需求和预算选择合适的加密方法。简单的密码保护适用于小型项目，而硬件加密锁和专业的加密工具则适用于需要更高安全性的项目。
定期更新和维护：加密措施需要定期更新和维护，以应对新的破解技术和工具。
备份重要数据：在进行加密前，确保备份所有重要数据和代码，以防加密过程中发生意外导致数据丢失。