软件公司在没有进项发票的情况下，可以采取以下几种方法来开具增值税发票：
简易征收方法
如果公司属于国家税务总局规定的无法取得进项的业务范畴，可以选择简易征收方式。按照3%的征收率纳税，并且可以开具增值税专用发票。
选择合适的纳税人身份
根据公司的经营规模和会计核算健全程度，增值税纳税人分为一般纳税人和小规模纳税人。一般纳税人适用一般计税方法，服务类企业适用的税率是6%；小规模纳税人适用简易计税方法，服务类企业适用的征收率是3%。
使用实际业务凭据
如果企业没有取得任何购进货物的发票，可以根据送货单等实际业务的凭据开具销项发票。这种情况下，企业不能抵扣增值税，也不能抵减企业所得税。
挂靠资质开票
一般挂靠资质的企业需要开票给客户时，可以通过挂靠的企业来带开，并需要支付相应的税金给挂靠单位。如果开票内容不特殊，企业也可以直接向税务局申请代开发票，但只能开具3%的专用发票。
一般纳税人进项税额的抵扣
对于一般纳税人，如果进项发票无法取得，可以尝试让出售货物的进项方重新开具发票，或者到税务局申请代开发票，并按照当月开票的销项税额全额缴税。
建议
合理规划税务：企业应根据自身业务情况和税务法规，选择合适的税务征收方式，确保合法合规经营。
财务管理：加强财务管理，确保取得足够的进项发票，以降低税负和税务风险。
咨询专业：在实际操作中，建议咨询专业的会计或税务顾问，以确保开票和纳税的准确性。