软件避免脱壳的方法主要包括以下几种：
使用DLL保护
将程序中的重要代码放在DLL（动态链接库）中，而不是直接放在EXE（可执行文件）中。
对EXE和DLL文件分别使用不同的加壳软件进行保护，这样需要同时脱掉两种壳才能获取原始代码。
连体婴儿保护
主程序文件被设计为仅有LOAD功能的文件，而真正的主程序文件在临时产生的文件中。
通过进程间通讯确保LOAD文件和临时产生的文件必须同时运行，否则执行出错。
在编程时加入对对方的CRC（循环冗余校验）保护机制，防止单独DUMP文件后脱壳。
选择合适的加壳软件
选择没有脱壳机或编写脱壳机难度较大的加壳软件，以增加反跟踪保护的强度。
将加壳保护和主程序编程在设计时进行统一设计，使得脱壳后无法正常执行，从而提高软件的安全性。
使用硬件加密保护
将软件与硬件设备绑定，使用硬件加密保护机制，使得软件无法在其他设备上运行，从而防止被脱壳和使用。
利用云计算平台
一些云计算平台上的编程软件依赖于云端的计算资源和服务，使得软件的代码无法被本地脱壳，从而提高安全性。
代码混淆和压缩
对JavaScript等脚本语言进行代码混淆和压缩，使得源代码难以阅读和理解，从而增加反编译的难度。
使用虚拟机保护
使用如VMP（Virtual Machine Protection）等虚拟机保护技术，使得软件在虚拟机中运行，从而增加反编译和脱壳的难度。
有意义的命名和加密
在编程时，使用有意义的函数命名，避免给Cracker提供过多的线索。
使用公钥加密算法保护软件，并将算法名称相关的字符串全部改名，以增加反编译的难度。
通过上述方法，软件可以在一定程度上避免被脱壳，从而提高其安全性。然而，需要注意的是，没有绝对的方法可以防止所有形式的脱壳，因此软件开发者需要不断更新和保护其代码，以应对新的威胁和挑战。