软件运行加密可以通过以下几种方法实现：
使用系统自带的加密功能
iOS和Android：系统自带的应用锁或屏幕锁功能可以防止未经授权的访问。Android系统中还可以为特定应用设置独立密码或指纹锁。
第三方加密应用
市场上有许多第三方加密应用，支持对应用本身、应用内的数据或整个文件夹进行加密。用户可以根据需求选择合适的加密级别和方式。
使用安全沙箱
安全沙箱是一种虚拟环境，可以隔离并保护应用和数据免受恶意软件的攻击。在安全沙箱中运行的应用，其数据将被加密存储，并与手机系统其他部分隔离。这种方式适用于处理敏感信息或进行金融交易的应用。
启用双重认证
双重认证为访问应用提供了额外的安全层，要求用户在登录时除了密码外还输入验证码（通常通过短信、电子邮件或身份验证应用发送），从而降低账户被盗用的风险。
代码加密
代码加密通过对软件代码进行加密处理，使得未授权的用户无法直接获取软件程序的源代码。常见的代码加密算法包括AES、DES等。
序列号授权
序列号授权通过分配高标准的序列号来控制软件的使用权，用户在安装软件时需要输入正确的序列号才能使用软件，从而防止软件被非法复制和传播。
硬件绑定
硬件绑定将软件与特定硬件绑定，确保软件只能在特定的硬件上运行，从而防止软件被非法复制和传播，并保护软件的知识产权。
时间限制
时间限制通过在软件中设置时间限制，限制软件的使用时间，防止软件被长期非法使用。时间限制可以通过软件自身的计时功能或外部的时间服务器来实现。
动态加密
动态加密在软件运行时对代码进行动态加密和解密，使得软件代码在内存中始终处于加密状态，从而有效防止软件被非法获取和篡改。
透明加密技术
透明加密技术允许用户在创建、修改或保存文件时无需进行额外操作，系统会自动对文件进行加密和解密。这种技术特别适用于企业内部文件保护，确保文件在公司内部可正常打开，一旦脱离授权环境，文件将无法打开或呈现乱码。
敏感词库
系统内置符合各行业敏感数据的识别库，通过敏感词库可以建立属于自己的核心数据识别体系，将散落在企业不同位置的敏感文档智能加密，维护企业核心知识产权。
实时监控与响应
实时监控和自动响应机制能够实时监控员工的电脑屏幕、记录截图和录像，并支持多屏监控，使管理员能够全面了解员工的工作状态和操作行为，从而提高安全性。
根据实际需求选择合适的加密方法，可以有效保护软件和数据的安全。建议在选择加密方法时，综合考虑安全性、易用性、兼容性和成本等因素。