在电视剧《还珠格格》中，小燕子和五阿哥永琪的结局是 在一起的。虽然过程中有一些波折，比如知画的介入和五阿哥回去为母亲尽孝两年，但最终五阿哥还是选择离开皇宫，去大理找小燕子，两人最终大团圆结局。
具体来说，在《还珠格格》的第三部中，虽然知画成为了五阿哥的侧福晋，并且他们生育了一个儿子绵亿，但五阿哥最终意识到知画的真面目，并决定与小燕子一起离开皇宫。他们最终在云南过上了幸福的生活。此外，也有剧情提到，五阿哥在离开皇宫两年后，回去为母亲尽孝，然后再去大理与小燕子重逢。
因此，可以确定的是，在《还珠格格》的故事中，小燕子和五阿哥最终是走到了一起，过上了幸福的生活。