加班打卡程序可以包括以下几个步骤：
加班申请
员工确因工作需要加班时，必须事先填写加班申请单，并经部门主管批准同意。特殊情况（如突发事件等）产生的加班，须事后补填加班单。
打卡时间
加班打卡的时间通常为下班后的20:00，即加班开始时间。员工需要在加班开始前进行打卡，以记录加班时长。
打卡方式
公司可以采用指纹打卡机、电子打卡或手工签到等形式进行考勤。员工应确保个人信息准确无误，不得代签或漏签。
加班单提交
加班单必须在事后次日交综合管理部，否则不予认可。加班单应包括加班时间、加班原因及加班时长等信息。
忘记打卡处理
上下班忘记打卡者，必须于次日由部门负责人签卡，但上下班忘记打卡限三次。忘记打卡者需填写忘打卡证明单，经部门主管签字后报行政部处理。
加班时长计算
加班时长按半小时计算，不足30分钟的忽略，工作时长扣除迟到、早退时长。加班时长以小时为单位进行统计和发放加班工资。
考勤管理
考勤打卡由公司人事行政部负责管理，所有考勤打卡资料、请假条由人事行政部统一制订版本格式。
监督与执行
各部门负责人协助监督实施打卡考勤制度，确保制度的有效执行。对于违反规定的行为，公司有权进行相应的处罚。
通过以上步骤，公司可以有效地管理加班打卡，确保员工加班记录的准确性和公平性，同时也有助于提高工作效率和劳动纪律。