自考档案丢失补办流程如下：
联系自考学校
联系自考毕业的学校，了解补办档案的具体要求和流程。需要提供一些证明材料，如身份证、毕业证等，并填写一份档案补办申请书。
准备材料
准备一些复印件或原件的资料，例如身份证、毕业证等，然后到学校相关部门提交申请，并填写一份档案补办申请书。
等待审核
等待学校审核，审核通过后，会给你复印好自考学籍材料，这些材料在档案管理人员审核没有问题后会密封装袋，使用密封条密封并且加盖公章，这样新的自考学籍档案就补办好了。
提交补办申请
向省自考办公室提交人事部门或档案管理部门申请补办，了解学校对毕业生补办学籍档案的具体要求等相关内容。
出具遗失证明
发现自考档案丢失后，应前往或联系自考档案所属的主考院校，说明档案丢失的情况，并申请开具档案遗失证明。这份证明是后续补办流程的必要材料。
填写申请表
根据主考院校或省自考办的要求，填写档案补办申请表。提交的材料会经过初审和复审两个阶段，主考院校或省自考办会根据档案内容重新制作或打印相关的档案材料。
补办材料
在出具遗失证明后，准备好毕业证书副本、考生身份证原件及复印件，提交到学校的学籍管理部门，工作人员会对材料和个人情况进行审核。审核通过后，需要拿着遗失证明以及各种身份证明和相关文件去毕业的学校补办毕业生登记表、学生成绩单等档案内所包含的材料。
审核与密封
补办完成后，将补齐的资料上交自考办公室，会有专业人品对你补齐的材料来进行审核，确认无误后，就会装入档案袋并加盖封条。
存档
补办好的自考档案需要存放在一个正确的地方，不要将其弄丢或者拆开。一般来说，最好将其存放在自己的手中，同时需要将原始档案和自考档案放在一起保存。如果原始档案存放在人才中心或就业单位等地方，需要将自考档案提交给人才中心或就业单位进行审核和存放。
及时托管
在补办完成后，应及时将档案托管到具有档案管理权限的单位，如人才中心或教育局指定的档案托管机构，以确保档案的安全和完整。
建议：
在补办自考档案时，务必与学校或自考办保持沟通，确保按照正确的流程和要求进行补办。
补办过程中可能需要提供多种证明材料，务必提前准备好所有相关文件。
补办完成后，应妥善保管新补办的档案，避免再次丢失。