双主轴复合机的编程可以通过以下步骤进行：
确定加工对象和加工要求
明确需要加工的工件及其加工要求，包括尺寸、形状、表面精度等。
选择合适的机床
根据加工对象的要求，选择具有双主轴功能的机床。双主轴加工中心通常有两个独立的主轴，可以同时进行不同的切削操作。
编写加工程序
使用CAD/CAM软件（如Mastercam、PowerMill、NX CAM、Edgecam等）进行编制，也可以手动编写。
程序需要包括主轴1和主轴2的指令，例如启动主轴、设置转速、进给速度、切换焦点等。
设定工件坐标系
在编写加工程序之前，需要确定工件坐标系。通常选择一个主轴为基准，其他主轴的坐标系根据其位置与基准主轴的关系确定。
设置刀具和切削参数
根据加工对象的特点，选择合适的刀具，并设置切削参数，包括切削速度、进给速度、切削深度等。每个主轴都需要设置相应的切削参数。
确定程序坐标系统
在编写加工程序时，需要确定程序坐标系统。通常选择相对于工件坐标系的刀具参考点进行编程，以方便程序的调试和修改。
运行加工程序
将编写好的加工程序加载到机床的数控系统中，并执行程序。在加工过程中，监控加工状态，及时调整切削参数以获得满意的加工结果。
检查加工质量
在加工完成后，对加工件进行检查，验证加工质量是否达到要求。如有需要，可以进行修磨或其他加工工序来改善加工质量。
示例编程指令
```
主轴1指令 M3（正转）
主轴1转速 S1000
主轴1进给 F200
主轴2指令 M42（切换到主轴2）
主轴2转速 S1200
主轴2进给 F250
```
注意事项
在使用CNC双主轴编程指令时，需根据具体的机床和加工要求进行编程设置，确保安全和准确性。
不同的机床和控制系统可能有不同的编程语法和指令集，因此在编程前应仔细查阅机床的用户手册或相关文档。
通过以上步骤和示例指令，可以完成双主轴复合机的编程工作，实现高效、精确的加工操作。