宝马编程后发动机故障灯亮可能有以下几种原因：
传感器问题
传感器包括水温、曲轴位置、空气流量、进气温度、氧传感器等。当这些传感器受损、接触不良或信号中断时，汽车的ECU无法准确获得发动机的数据，从而导致发动机故障灯亮起。
油液问题
油液包括冷却液、机油和燃油。缺少油液或者油液不符合使用条件，会导致发动机运行不平稳，磨损加快，进而点亮发动机故障灯。
混合气燃烧不良
火花塞故障、点火线圈故障、燃油泵故障、油路堵塞等问题都会导致混合气燃烧不良。混合气燃烧不良会导致积碳或爆震，从而被氧传感器监测到并报告给ECU，导致发动机故障灯点亮。
保养问题
发动机保养不当会导致老化、故障，从而引发发动机故障灯亮起。建议按照车辆保养手册上的时间或公里数进行定期保养。
燃油或机油品质问题
使用不符合要求的燃油和机油会加剧发动机的磨损，导致故障灯亮起。应使用符合厂家要求的燃油和机油。
增压问题
进气增压管路或涡轮增压器故障也会导致发动机故障灯点亮。常见症状包括漏油、机油消耗量大、动力下降、金属异响、排气管冒蓝烟或黑烟等。
编程或诊断问题
编程有时是为了诊断故障，当发动机故障灯亮起时，它只是一个指示灯，告诉驾驶员发动机系统存在问题。通过编程，技术人员可以重置故障码，以便确认问题是否已解决或确定需要进一步的维修。
建议：
首先，建议使用宝马车辆的诊断系统进行检测，读取故障码，并根据这些故障码确定具体的故障位置和性质。
根据诊断结果，进行相应的维修或更换损坏的部件，如传感器、燃油泵、火花塞等。
确保使用符合厂家要求的燃油和机油，并按照保养手册的要求进行定期保养。
如果问题仍然存在，建议前往宝马授权维修中心进行进一步的检修。