U盘装系统通常推荐使用 NTFS格式。NTFS（New Technology File System）是Windows NT及其后续版本（如Windows 2000、Windows XP、Windows Server 2003、Windows Server 2008、Windows Vista和Windows 7）的标准文件系统。NTFS提供了长文件名支持、数据保护和恢复功能，并通过目录和文件许可实现了安全性。它还支持大硬盘和在多个硬盘上存储文件（称为卷）。
尽管在有些情况下，如安装Windows 7系统时，可能需要使用FAT32格式，但总体而言，NTFS格式在U盘装系统时更为常用，因为它提供了更好的性能和安全性。
在制作U盘启动盘时，请确保选择NTFS格式，以便能够顺利启动和安装系统。如果使用电脑店U盘启动盘工具，则ISO和GHO格式镜像都可以使用，因为这些工具通常支持这两种文件模式。
总结：
推荐格式：NTFS
其他可选格式：FAT32（某些特定情况）
建议在制作U盘启动盘时选择NTFS格式，以确保系统的稳定性和安全性。