祖祠翻建程序一般包括以下几个步骤：
前期准备阶段
调研与规划：确定修建宗祠的需求，进行所在地区的规划与调研，包括土地使用政策和规划、土地所有权、宗祠规模和结构等方面的内容。
筹备资源：筹备修建宗祠所需的资金、人力、物资等资源，并确保其来源合法和可靠。可以通过家族成员、捐款或其他合法途径进行筹资。
办理手续：在开始修建宗祠前，确保办理所有相关证件和手续，如申请土地使用许可、建筑许可证等，并了解相关的法律法规，确保操作合法合规。
设计与施工阶段
设计方案：委托专业的设计师或建筑师进行宗祠的设计方案制定，确保方案符合宗祠的功能需求和文化传统，并兼顾实用性和美观性。
施工队伍：选择有资质和经验的施工队伍进行宗祠的施工，确保施工队伍的技术水平和工程质量。
施工过程：按照设计方案和工程计划进行施工，保证施工质量和进度，并及时进行验收和整改。
安全措施：在施工过程中，加强安全管理，确保工地环境整洁、安全，并采取必要的安全措施。
后期验收阶段
质量验收：在宗祠建设完成后，进行质量验收，确保所有工程符合设计要求和建筑标准。
法律验收：确保所有相关手续和证件齐全，符合法律法规要求，避免因手续不全导致的法律风险。
庆祝活动
祭祖庆祝：祠堂落成后，举行祭祖庆祝大典，以纪念祖先并庆祝宗祠的重建完成。
建议在翻建祖祠时，先咨询当地民宗部门和国土部门，了解具体的重建流程和所需手续，确保整个过程的合法性和顺利进行。