母公司合并子公司的流程主要包括以下几个步骤：
股东会决议
拟合并的公司股东会分别做出合并决议。
编制资产负债表和财产清单
合并各方分别编制资产负债表和财产清单。
签订合并协议
各方签署《合并协议》，协议内容应包括合并各方的名称、住所、法定代表人，合并后公司的名称、住所、法定代表人，合并后公司的注册资本，合并形式，合并协议各方债权、债务的承继方案，违约责任，解决争议的方式，签约日期、地点及其他必要事项。
通知债权人及公告
自作出决议之日起10日内通知债权人。
自作出决议之日起30日内在报纸上公告登报。
会计处理
进行调账、报表合并等会计处置。
实收资本验证
合并报表后实收资本的验证。
申请登记
自作出决议之日起45日以后向登记机关申请登记，子公司申请注销登记，母公司申请变更登记。
以上步骤完成后，合并流程即告完成。需要注意的是，整个合并过程应严格遵循相关法律和公司章程的规定，确保合法合规。