公司变更章程的程序主要包括以下几个步骤：
提议修改公司章程
通常由公司董事会提出修改公司章程的建议。
提议时机应在会议期间之外，经过充分讨论和准备。
通知股东
修改公司章程属于股东（大）会的审议事项，需要通知全体股东。
通知时间要求：有限责任公司应于会议召开十五日前通知全体股东；股份有限公司应于会议召开二十日前通知各股东。对于临时会议，应提前十五日通知各股东；若发行无记名股票，则需提前三十日进行公告。
股东大会决议
股东（大）会是公司章程修改的法定职权机构。
表决要求：有限责任公司章程的修改需经代表三分之二以上表决权的股东通过；股份有限公司章程的修改则需经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
审批与公告
若股东大会决议通过的章程变更事项需经主管机关审批，公司需按要求报主管机关批准。
特定章程变更事项，如经营范围的重大变化，应当依法进行公告，以确保相关方及时了解并遵守新的公司章程。
变更登记
公司章程变更后，公司董事会应向工商行政管理机关申请变更登记。
如果公司章程的修改未涉及登记事项，公司应将修改后的公司章程或修正案送交公司登记机关进行备案。
提交必要文件
向公司登记机关提交股东会决议、章程修正案、营业执照、法定代表人的身份信息等资料。
总结：
公司变更章程的程序包括提议修改、通知股东、股东大会决议、审批与公告、变更登记及提交必要文件等步骤。每一步都需严格遵循《公司法》及相关法规的规定，以确保变更过程的合法性和有效性。