手机停机后多久自动注销，主要取决于手机所使用的服务提供商的规定。一般来说，手机停机三个月后，系统会自动进入销号状态，并进行自动注销。然而，也有可能出现一些特殊情况，例如用户未结清欠费，或者手机在停机期间仍然产生费用，这可能会导致注销时间被延迟。
此外，不同的运营商可能有不同的规定。例如，中国移动的规定是，如果手机卡停机后60天内没有使用记录和缴费记录，该号码可能会被自动注销，但在某些特殊情况下，这个时间可能会延长至90天。中国电信的规定也类似，如果在停机后90天内没有使用记录和缴费记录，手机卡同样会被自动注销。
因此，为了避免因未及时结清欠费而被自动注销，建议用户定期检查自己的手机使用情况，并在手机停机后尽快结清所有欠费。如果需要长期不使用手机，建议主动联系运营商进行销号处理，以避免不必要的麻烦。