手机分期逾期后，其征信记录将在 5年后自动消除。根据《征信业管理条例》第十六条的规定，个人不良信息的保存期限自不良行为或事件终止之日起为5年，超过5年的应当予以删除。
因此，如果您已经还清了手机分期的逾期款项，那么从还清之日起计算，5年后您的征信记录将自动消除。需要注意的是，这个5年期限是从不良行为或事件终止之日开始计算的，而非从逾期行为发生之日开始计算。此外，如果您在不良信息保存期限内对不良信息作出了说明，征信机构应当予以记载。
如果您对征信记录的消除时间有疑问，可以在5年期满后的一个月内查询征信报告，以确认逾期记录是否已消除。