程序的运行成本通常包括多个方面，具体计算方式如下：
营业成本
营业成本是运营成本的一部分，包括主营业务成本和其他业务成本。
营业成本也称“经营成本”，是指企业所销售商品或者提供劳务的成本。
营业成本应当与所销售商品或者所提供劳务而取得的收入进行配比，是与营业收入直接相关的各种直接费用，包括主营业务成本以及其他业务成本。
运营成本
运营成本是指企业为维持正常运营而发生的成本，包括人员工资、租金、水电费、设备维护费等。
运营成本的计算需要考虑所有与产品或服务提供直接相关的费用。
计税方式
企业的运营成本在计税时可以选择不同的方式，如按照收入比例计税或按照实际发生额计税。
选择合适的计税方式可以帮助企业合理规划税务，降低税负。
建议
详细记录：企业应详细记录所有与程序运行相关的成本，包括直接成本和间接成本，以便准确计算运行成本。
合理分类：将成本按照性质进行分类，如人力成本、技术成本、管理成本等，有助于更好地管理和控制成本。
定期审计：定期对运行成本进行审计，确保成本数据的准确性和合规性，同时发现潜在的成本节约空间。
通过以上步骤，企业可以更准确地计算程序的运行成本，从而为成本控制和决策提供有力的支持。