三次元编程笔记的整理可以按照以下步骤进行：
分析图纸
给图纸尺寸及形位公差编号。
准备并清洁工件与夹具。
选用合适的探针或组装新的探针
选择合适的探针或根据需要组装新的探针（Stylus System）。
校准测针。
建立基本坐标系
根据基准建立基本坐标系（Base Alignment）。
若主坐标系过于复杂，可考虑建立初定位坐标系（Start Alignment）。
建立安全平面
建立安全平面（Clearance Plane）。
提取元素及构建
按照编号顺序提取元素（Features）及构建（Construction）。
输出特性（Size & Form and Location）。
修改名义值（Nominal）、公差（Tolerance）、名称（Name）。
根据需要评定（Evaluation），勾选滤波（Filter）与去除粗大误差（Outlier elimination）。
修改策略
单点变轨迹：根据需要给平面加多义线（polyline）、网格（grid），给圆加自动圆轨迹（Circle auto path），给圆柱加两圆（2 Circle auto path）或者螺旋线轨迹（Helix）。
修改速度（Speed）、修改点数（Number of points）、修改起始角度（Start angle）、角度范围（Angle range）、修改截面高度（Height）。
检查五项参数
程序元素编辑（Measurement Plan Editor Features）。
安全平面组（Clearance Group）。
通过以上步骤，可以系统地整理三次元编程的笔记，确保每个步骤都详细记录，方便后续查阅和复习。