法院查封房产的程序如下：
法院向国土房产部门发出《协助执行通知书》及附带的法律文书 。办案人员向国土房产部门出示法院工作证，并根据不同情形办理查封手续
已核发房地产证的标的物：
应提交国土房产局档案室出具的查册表。
预售商品房：应提交房地产交易所出具的该预售商品房的交易情况表或该楼盘的明细表。
土地：应先到国土房产局档案室查清该土地权属情况，并提交查册的书面结果。
国土房产部门根据法院提交的资料，进行查封处理。
此外，法院查封房产后，会发布腾房公告，通知房产的占有人或使用人，告知他们房产已被法院查封，并要求他们在规定的时间内搬离房产。查封期满后，如债务人已按照判决或裁定履行了义务，或者法院认定查封有误，可以依法解除查封。