工程总量减少程序可以按照以下步骤进行：
提出变更请求
甲方应书面提出变更请求，明确变更的内容、理由、时间以及费用计算方式。
协商确定费用
甲乙双方应就变更费用进行协商，并在确认后签署变更协议。
修改合同
如果双方达成一致，需要对原合同进行修改，以反映工程量减少的变更，包括调整项目范围、工期和总价等相关条款。
签署变更协议
修改合同的条款得到双方认可后，需要签署正式的变更协议，以确认工程量减少和相关的合同调整。
履行变更后的合同
双方应按照变更后的合同条款执行，确保工程量和费用调整得到妥善处理。
建议：
在整个过程中，双方应保持充分沟通，确保变更过程透明、公正，避免后续纠纷。
若变更导致合同无法履行，应提前通知对方，并承担相应的违约责任。