铣螺纹钻底孔的编程步骤如下：
建立坐标系和刀具长度补偿
使用G54-G59指令选择工件坐标系。
使用G43H1Z50指令（对于钻头）或G43H2Z50指令（对于丝锥）建立刀具长度补偿。
移动刀具到起始位置
使用G0X50Y50指令（或其他适当的X、Y坐标）将刀具移动到钻孔位置。
启动主轴
使用M03指令启动主轴。
钻孔循环
使用G99G82Z-35R5P1000F180指令（或其他适当的Z、R、P、F参数）进行第一个孔的钻孔，抬刀到R点。
重复上述步骤，完成所有孔的钻孔。
使用G80指令取消钻孔循环。
抬刀和停止主轴
使用G0Z200指令将刀具抬升到安全位置。
使用M05指令停止主轴。
换刀
使用M06T2指令换刀为丝锥T2。
攻丝循环
使用G90G99G84Z-35R5P600F500指令（或其他适当的Z、R、P、F参数）进行第一个孔的攻丝，抬刀到R点。
重复上述步骤，完成所有孔的攻丝。
示例程序
```gcode
； 设置刀具
T1 9 ； 钻头直径9mm
T2 M10*1 ； 丝锥M10*1
； 建立坐标系和刀具长度补偿
G54G90G0X0Y0
G43H1Z50
； 移动到钻孔位置
G0 X50Y50
； 主轴启动
M03 S700
； 钻第一个孔
G99G82Z-35R5P1000F180
Y250 ； 钻第二个孔
X150 ； 钻第三个孔
G98Y50 ； 钻第四个孔
G80
； 抬刀，主轴停止
G0 Z200
M05
； 换刀
M06T2
； 建立刀具长度补偿
G43H2Z50
； 移动到钻孔位置
G0 X50Y50
； 主轴启动
M03 S500
； 攻丝第一个孔
G90G99G84Z-35R5P600F500
Y250 ； 攻丝第二个孔
X150 ； 攻丝第三个孔
```
建议
选择合适的刀具和参数：根据具体的加工要求和工件材料，选择合适的钻头和丝锥，以及合适的切削速度和进给速度。
检查加工路径：在模拟铣削过程中，检查加工路径是否合理，是否存在干涉等问题。
实际加工前测试：在正式加工前，进行试加工以验证程序的正确性和有效性。